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大連化物所揭示去泛素化與泛素化分子相互作用網(wǎng)絡(luò)

儀表研發(fā) 2019年09月24日 11:18:12來(lái)源:大連化學(xué)物理研究所 18164
摘要近日,中國(guó)科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所生物技術(shù)研究部生物分子功能研究組研究員樸海龍團(tuán)隊(duì)基于生物信息學(xué)方法,揭示了癌癥中關(guān)鍵的去泛素化與泛素化分子相互作用網(wǎng)絡(luò)。

  【儀表網(wǎng) 儀表研發(fā)】近日,中國(guó)科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所生物技術(shù)研究部生物分子功能研究組研究員樸海龍團(tuán)隊(duì)基于生物信息學(xué)方法,揭示了癌癥中關(guān)鍵的去泛素化與泛素化分子相互作用網(wǎng)絡(luò)。
 
  去泛素化與泛素化作用是生命體內(nèi)至關(guān)重要的轉(zhuǎn)錄后修飾作用,參與到細(xì)胞周期、免疫調(diào)控、信號(hào)傳遞等幾乎所有的生物學(xué)通路過(guò)程中。同時(shí),該作用體系對(duì)于癌癥的發(fā)生和發(fā)展也發(fā)揮重要作用。其中,去泛素化與泛素化作用分別依賴于去泛素化酶及E3泛素連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)底物的特異性識(shí)別。然而,無(wú)論是去泛素化酶還是E3泛素連接酶,其蛋白種類多樣,并且與底物之間呈現(xiàn)“多對(duì)多”的復(fù)雜相互作用關(guān)系。目前,尚有很多“去泛素化酶-底物”相互作用及“E3泛素鏈接-底物”相互作用未被揭示。
 
  該團(tuán)隊(duì)通過(guò)對(duì)生物分子結(jié)構(gòu)信息、蛋白質(zhì)組學(xué)表達(dá)譜、基因組表達(dá)譜、分子網(wǎng)絡(luò)等生物大數(shù)據(jù)資源的深入挖掘,分別構(gòu)建了針對(duì)“去泛素化酶-底物”及“E3泛素連接酶-底物”相互作用的預(yù)測(cè)模型,實(shí)現(xiàn)對(duì)潛在未知底物的識(shí)別,并結(jié)合分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)對(duì)計(jì)算結(jié)果進(jìn)行了驗(yàn)證。同時(shí),在對(duì)“去泛素化酶-底物”相互作用的研究中,進(jìn)一步融合癌癥多組學(xué)數(shù)據(jù)資源,揭示了多種癌癥中具有癌癥特異性功能的“去泛素化酶-底物”相互作用。相關(guān)研究結(jié)果將為泛素化、去泛素化作用體系的研究提供有利參考,同時(shí)促進(jìn)發(fā)現(xiàn)靶向泛素化、去泛素化作用體系的新型癌癥治療靶標(biāo)。
 
  兩項(xiàng)工作得到國(guó)家自然科學(xué)基金、博士后基金、大連化物所創(chuàng)新基金及中科院百人計(jì)劃項(xiàng)目的資助,并于近日分別發(fā)表于Oncogene及iScience 雜志上。

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