在水體中，富有植物一般都含有葉綠素a，因此利用葉綠素的熒光效應可以檢測出水體中的植物生物量，但一般很難特異性地檢測出藍藻地含量。在內陸湖泊水華中，藍藻是優勢生長藻類，也是水華爆發地主導物種；同時藍藻中藻藍蛋白具有特征的645nm熒光譜。因此，利用葉綠素a和藻藍蛋白的特征光譜可準確地檢測出水體中的藍藻濃度含量。藍藻熒光傳感的工作原理如下圖所示。

在水體中，激發的葉綠素于藻藍蛋白熒光強度于藍藻的濃度也具有正比關系，下圖是用上述傳感器檢測不同藍藻濃度時的曲線，在較小的濃度范圍內，傳感器都能靈敏地測試出藍藻含量，在0.1μg/L地濃度時，輸出電壓達到了3.4V。并且輸出電壓于藍藻濃度具有很好的線性對應關系，期線性相關系數達到了0.99。通過調節傳感器中可變增益地信號放大倍數，可以實現高濃度的藍藻檢測。

禹山藍綠藻傳感器是利用藍藻在光譜中有吸收峰和發射峰這一特性，在藍藻的光譜吸收峰發射單色光照射到水中，水中的藍藻吸收單色光的能量，釋放出另外一種波長發射峰的單色光，藍藻發射的光強與水中藍藻的含量成正比。該傳感器安裝簡單使用方便。通過熒光分析法來監測藍綠藻的含量。該方法直接檢測藍綠藻細胞中特定色素的熒光物質，以確定相對的藻類毒素。
藍綠藻傳感器的功能：
基于色素的熒光性測量目標參數的，可在潛在的水造成影響前進行識別；
數字化傳感器，抗干擾的能力強，傳輸距離遠；
傳感器現場安裝方便快捷，實現即插即用；在線連續監測，實時掌握水質動態；
可選自動清潔刷、防止沾污，清除水樣中附著物；
可對藻類的繁殖起到預警作用；維護周期更長，長期在線使用也能保持穩定性。