氣相色譜對小分子化合物具有很高的分辨率，配備高效EI離子源的質譜儀本身具有高的靈敏度，極低的檢測限，輔以精確質量數軟件和相應譜庫，極大增強了氣質聯用儀的定性和定量能力。使其成為同時具備精確質量高分辨和超高靈敏度的分析儀器，特別適合生物代謝物，環境污染物等有機物的定性定量分析。
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